Rekombinasi DNA | Kloning DNA (Prinsip Dasar: DNA Rekombinan, fusi sel atau fusi protoplasma dan kultur jaringan)

4 min read

Rekombinasi DNA

Rekombinasi DNA

Rekombinasi DNA atau kloning DNA adalah merupakan metode yang digunakan untuk membuat replika genetik dari satu segmen DNA, sel atau organisme secara keseluruhan.

Untuk apa rekombinasi DNA / DNA kloning itu digunakan?

Kloning DNA digunakan untuk membuat sejumlah besar salinan gen atau potongan DNA lainnya.

DNA yang dikloning dapat digunakan untuk:

  • Cari tahu fungsi gen.
  • Selidiki karakteristik gen (ukuran, ekspresi, distribusi jaringan).
  • Teknologi rekombinasi DNA penting dalam memproduksi vaksin dan terapi protein seperti insulin manusia, interferon, dan hormon pertumbuhan manusia. Juga digunakan dalam faktor pembekuan untuk mengobati hemophilia dan dalam pengembangan terapi gen.

Apa jenis kloning atau rekombinasi DNA lainnnya?

Istilah ‘kloning’ juga digunakan untuk menggambarkan proses laboratorium lainnya:

  • Kloning reproduksi adalah proses pembuatan salinan organisme yang identik secara genetis.
  • Kloning terapi adalah proses membuat banyak salinan sel untuk mengobati suatu penyakit.

Fungsi rekombinasi DNA / DNA kloning

Kloning DNA dapat digunakan dalam serangkaian aplikasi yang luas, seperti misalnya:

  • Produksi protein: Jika DNA hasil kloning mengkodifikasi untuk protein, sejumlah besar bakteri ditanam dalam fermentor industri, yang darinya protein yang diinginkan dapat dimurnikan. Protein ini biasanya adalah biofarmasi, seperti misalnya, insulin.
  • Analisis genetik: Memiliki jumlah DNA yang lebih besar memungkinkan untuk menganalisis materi genetik secara terperinci, mempelajari transkripsi DNA, menerjemahkan transkrip, memprofilkan DNA untuk mencari sekuens tertentu (termasuk penyelidikan forensik dan kriminal), amplifikasi sejumlah kecil materi genetik, dll.
  • Terapi gen: Urutan DNA spesifik dapat digunakan untuk menghasilkan protein secara langsung ke dalam sel-sel di mana gen yang rusak menyebabkan penyakit genetik. Serangkaian teknik ini disebut sebagai “terapi gen” dan memungkinkan mengobati penyakit yang sebelumnya tidak dapat diobati.

Bagaimana kloning DNA / rekombinasi DNA dilakukan?

Untuk dapat mengkloning DNA, kita membutuhkan elemen-elemen berikut:

  1. Sumber DNA yang menarik: biasanya, sejumlah besar DNA yang diinginkan diperlukan dalam bentuk jaringan, kultur bakteri, dll. Dari sini, DNA diekstraksi melalui teknik ekstraksi konvensional.
    Plasmid: Agar bisa mendapatkan banyak salinan DNA, kita membutuhkan molekul DNA yang dapat mereplikasi diri yang mampu membawa fragmen DNA yang menarik. Molekul DNA ini disebut plasmid, dan mereka ada secara alami di beberapa mikroorganisme. Plasmid ini dapat diperoleh dalam beberapa salinan per sel, karena itu dimungkinkan untuk mendapatkan jumlah DNA yang besar untuk bekerja dengannya.
  2. Enzim restriksi: Kloning DNA dimungkinkan karena dapat dipotong di tempat tertentu (urutan-spesifik) berkat sejumlah besar protein yang disebut “enzim restriksi” yang muncul secara alami pada banyak bakteri.
  3. Sel: Kita membutuhkan sel hidup untuk mengenalkan plasmid dan memperbesar jumlahnya. Biasanya bakteri digunakan, sangat nyaman juga berkat tingkat pertumbuhannya.

Langkah dasar untuk membuat rekombinasi DNA / kloning DNA

  1. Ekstraksi DNA berkat Kit Ekstraksi DNA & RNA.
  2. Analisis pembatasan dan penggunaan enzim restriksi untuk memotong fragmen DNA yang cocok untuk dikloning.
  3. Memotong plasmid dengan enzim restriksi yang sesuai agar dapat memasukkan fragmen yang diinginkan di dalamnya.
  4. Menggunakan enzim pengubah DNA enzimatik (mis. T4 DNA Ligase) untuk mendapatkan keseluruhan, plasmid-DNA insert (fungsional plasmid) yang mampu mereplikasi diri.
  5. Pengenalan plasmid ke dalam sel melalui teknik yang disebut transformasi.
  6. Kultur sel yang menyimpan plasmid untuk memperbesar jumlahnya.
  7. Pemilihan sel yang membawa plasmid dan masukkan ke dalam lempeng kultur melalui antibiotik dan zat kromogenik, menunjukkan adanya plasmid dan fragmen DNA.
  8. Batasan atau analisis urutan untuk memeriksa urutan DNA hasil kloning.

Prinsip dasar Rekombinasi DNA

Prinsip dasarnya adalah menggabungkan DNA atau gen suatu makhluk hidup (biasanya gen dari bakteri) kepada makhluk hidup yang berbeda jenis (bisa manusia atau tikus) untuk tujuan tertentu (seperti membentuk insulin).

Tiga prinsip dasar dalam rekayasa genetika meliputi Rekombinasi DNA atau DNA Rekombinan, fusi sel atau fusi protoplasma, dan kultur jaringan.

Prinsip Dasar 1: DNA Rekombinan

Rekombinasi DNA atau DNA rekombinan adalah proses penggabungan DNA—DNA dari sumber yang tidak sama. Tujuannya yakni untuk menyambungkan gen yang ada di dalamnya.

Itulah sebabnya rekombinasi DNA juga disebut sebagai rekombinasi gen. Rekombinasi DNA dapat dilakukan kerena alasan-alasan sebagai berikut:

a) Struktur DNA setiap spesies makhluk hidup sama
b) DNA dapat digabungkan atau disambungkan

Tahapan DNA rekombinasi, sebagai berikut:

a) Mengisolasi DNA, untuk memilih serta memilah DNA maupun gen yang diinginkan

b) Transplantasi DNA, ditindaklanjuti dengan menyambung DNA yang telah diisolasi ke dalam DNA plasmid vektor. Dengan cara ini, vektor akan mengandung DNA asli dan DNA sisipan.

c) Memasukkan DNA ke dalam sel hidup, DNA dimasukkan ke dalam bakteri sehingga ikut juga membelah diri.

Prinsip Dasar 2: Fusi Sel

Fusi sel yaitu peleburan dua sel, yakni bisa dari spesies yang sama ataupun dari spesies berbeda agar terbentuk sel hibridoma atau bastar.

Fusi sel sangat bermanfaat yakni untuk pemetaan kromosom, membuat antibodi, dan juga membentuk spesies baru.

Pada fusi sel perlu terdapat unsur berikut:

  • Sel sumber gen (sumber sifat ideal).
  • Sel wadah (sel yang mampu membelah cepat).
  • Fusi gen (zat-zat yang dapat mempercepat fusi sel).

Prinsip Dasar 3: Kultur Jaringan

Kultur jaringan yaitu teknologi yang didasari oleh teori totipotensi.

Teori totipotensi menjabarkan bahwa:

  • Setiap sel tumbuhan akan dapat berkembang menjadi individu baru jika ditempatkan pada media yang sesuai.
  • Sifat totipotensi ini pada jaringan tumbuhan dimanfaatkan untuk memperoleh keturunan secara seragam dalam jumlah banyak serta terjadi dengan cepat.

Keuntungan menggunakan kultur jaringan adalah:

  • Kita bebas menentukan bagian mana pada tumbuhan yang akan dikultur
  • Cenderung memakan relative singkat
  • Tidak harus menggunakan ruangan yang luas
  • Dapat menghasilkan jumlah tanaman yang baru dari satu jenis tanaman dengan cepat.

Jenis-Jenis Teknik Kultur Jaringan

  1. Meristem culture,yakni kultur jaringan yang menggunakan bagian tanaman dari jaringan muda atau meristem
  2. Pollen atau Anther culture,yakni teknik kultur jaringan dengan menggunakan bagian tanaman berupa benang sari atau serbuk sari.
  3. Chloroplast culture, yakni teknik kultur jaringan menggunakan kloroplas untuk keperluan memperbaiki sifat tanaman melalui pembuatn varietas baru
  4. Somatic cross atau persilangan protoplasma, yakni persilangan dua macam protoplasma menjadi satu,kemudian dibudidayakan sehingga dihasilkan tanaman yang mempunyai sifat baru.
Rekombinasi DNA
Keberhasilan dan kemudahan mengkloning fragmen DNA ke dalam vektor plasmid tergantung pada beberapa faktor. Kloning secara signifikan lebih berhasil ketika hanya ada satu fragmen DNA yang akan diikat ke dalam vektor plasmid. Ilustrasi dan sumber foto: Wikimedia Commons

Contoh Vektor DNA Kloning / Rekombinasi DNA

Berbagai Vektor yang Digunakan untuk Membawa Sisipan DNA untuk Kloning

Jenis VektorSel InangBatas Ukuran Penyisipan  DNAFitur
Plasmid Bakteria 0.1–10.0 kilobases (kb) Sistem vektor yang paling banyak digunakan, mudah digunakan
Lambda phage Bakteria 8.0–20.0 kb Efisiensi transformasi yang lebih tinggi dan membawa pemasukan yang lebih besar, tetapi lebih sulit digunakan daripada plasmid
Cosmid Bakteria 35.0–50.0 kb Kombinasi plasmid dan Cos dari lambda phage; juga memiliki efisiensi transformasi tinggi dan membawa insert lebih besar daripada lambda
Bacterial Artificial Chromosome (BAC) Bakteria 75.0–300.0 kb Membawa sisipan DNA besar; digunakan untuk mengurutkan genom organisme (mis., proyek genom manusia); menunjukkan efisiensi transformasi yang lebih tinggi daripada YAC
Yeast Artificial Chromosome (YAC) Ragi (Eukariota) 100.0–2000.0 kb Membawa sisipan DNA yang sangat besar, tetapi efisiensi transformasi rendah

Bacaan Menarik Seputar DNA, Darah, Sel dan Kanker

Bacaan Lainnya

Unduh / Download Aplikasi HP Pinter Pandai

Respons “Ooo begitu ya…” akan lebih sering terdengar jika Anda mengunduh aplikasi kita!

Siapa bilang mau pintar harus bayar? Aplikasi Ilmu pengetahuan dan informasi yang membuat Anda menjadi lebih smart!

Sumber bacaan: Science Learn, Canvax Biotech, Science Direct, National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine (NCBI)
Pinter Pandai “Bersama-Sama Berbagi Ilmu”
Quiz | Matematika | IPA | Geografi & Sejarah | Info Unik | Lainnya | Business & Marketing